哈工大報訊(生命 文/圖)8月14日,黃志偉教授課題組關(guān)于新冠肺炎的最新研究成果以《新冠肺炎重癥和輕癥患者對新冠病毒感染的適應(yīng)性免疫反應(yīng)》(Adaptive immune responses to SARS-CoV-2 infection in severe versus mild individuals)為題在線發(fā)表于《信號轉(zhuǎn)導與靶向治療》(Signal Transduction and Targeted Therapy)雜志。
截至2020年6月,SARS-CoV-2引起的全球范圍的新冠肺炎疫情已經(jīng)影響到800多萬人,為了研究COVID-19患者針對SARS-CoV-2感染的適應(yīng)性免疫反應(yīng)機制及康復(fù)患者的免疫記憶建立情況,該團隊首先應(yīng)用單細胞轉(zhuǎn)錄組和免疫組(TCR/BCR)高通量測序數(shù)據(jù),并結(jié)合功能實驗對疾病嚴重程度不同的COVID-19患者(重癥和輕癥)外周血中適應(yīng)性免疫細胞的響應(yīng)機制進行了研究,揭示了T/B細胞針對SARS-CoV-2感染而進行的免疫組庫重建特征,以及COVID-19誘導的外周血淋巴細胞亞群組成變化特征,發(fā)現(xiàn)了T細胞免疫記憶和B細胞體液免疫反應(yīng)程度與疾病嚴重程度存在一定的正相關(guān)性,以及重癥和輕癥患者不同的免疫學變化特征(圖一)。
該研究首先發(fā)現(xiàn),相比于健康人,COVID-19患者表達細胞毒性分子(如GZMA、GZMB、PRF1、NKG7)的殺傷性T細胞亞群(CD8+效應(yīng)記憶細胞(CD8+ TEM)、表達CD45RA的CD8+ TEM細胞亞群(CD8+ TTE)和CD4+TTE)的占比提高,表明這些殺傷性T細胞的增殖與COVID-19有關(guān);同時發(fā)現(xiàn)COVID-19患者中的黏膜相關(guān)恒定T淋巴細胞(MAIT)顯著減少;而SARS-CoV-2誘導的Gamma/delta T細胞消耗在恢復(fù)期患者中得到一定程度的恢復(fù),但仍未完全恢復(fù)到正常水平,這些結(jié)果表明COVID-19患者的適應(yīng)性免疫系統(tǒng)在康復(fù)早期并未得到完全恢復(fù)。
為了識別恢復(fù)期COVID-19患者中SARS-CoV-2特異性T細胞亞群,團隊首先通過scRNA-seq和scTCR-seq研究不同T細胞亞群的克隆擴增情況,發(fā)現(xiàn)對SARS-CoV-2響應(yīng)的主要T細胞亞群包括CD8+ TEM、CD8+ TTE和CD4+TTE。為了研究這些克隆擴增的T細胞亞群是否靶向新冠病毒,用來自新冠病毒的276條潛在的T細胞抗原表位多肽刺激輕、重癥患者的T細胞,并檢測其反應(yīng)活性,發(fā)現(xiàn)康復(fù)期的COVID-19患者體內(nèi)存在靶向S蛋白等新冠病毒蛋白的特異性記憶T細胞,且發(fā)現(xiàn)來自重癥患者的樣本表現(xiàn)出更強烈的特異性T細胞反應(yīng),表明相較于輕癥患者,重癥患者對于SARS-CoV-2具有更強的記憶T細胞反應(yīng)性。
在B細胞免疫反應(yīng)方面,通過整合B細胞轉(zhuǎn)錄組和BCR免疫組測序數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)在重癥患者中具有更明顯的BCR克隆擴增,相比于正常人和輕癥患者漿細胞占比更高,并且由B細胞介導的免疫通路和補體激活通路發(fā)生上調(diào),這些結(jié)果說明更強烈的體液免疫反應(yīng)是重癥患者的典型特點。
進一步評估早期康復(fù)患者適應(yīng)性免疫系統(tǒng)的恢復(fù)情況,發(fā)現(xiàn)在所有康復(fù)患者的大部分T/B細胞中未檢測到促炎細胞因子的明顯表達,表明在COVID-19患者的康復(fù)早期促炎細胞因子可能已經(jīng)恢復(fù)到正常水平。值得注意的是,有絲分裂原活化蛋白激酶(MAPK)通路(FOS、JUN、JUNB和DUSP1)的表達在所有COVID-19康復(fù)患者中均受到抑制,這也與之前的報道發(fā)現(xiàn)一致。
此外,本研究還發(fā)現(xiàn)了不同COVID-19患者的抗病毒反應(yīng)存在很大的異質(zhì)性,同時也提示了不同個體存在不同的抗病毒反應(yīng)機制的可能性,給后續(xù)更大規(guī)模的隊列研究提出了更多的可能性。比如,有很多研究已表明I型和Ⅲ型干擾素(IFN)信號通路在SARS-CoV-2或SARS-CoV感染中發(fā)揮重要作用。而在本研究中,僅在1例危重癥感染病例和1例輕度感染病例中檢測到T細胞IFN應(yīng)答,這種IFN應(yīng)答的異質(zhì)性表明在SARS-CoV-2感染過程中T細胞IFN通路的激活及其與臨床表型和抗病毒免疫反應(yīng)之間的關(guān)系仍有待進一步闡明。在一例年輕的重癥病人(44歲)中還發(fā)現(xiàn)了IGHV4-34 BCR克隆的高度擴增,而這種克隆型很少出現(xiàn)在健康個體的IgG記憶性B細胞中,且有研究表明其與一些自身免疫性疾病相關(guān),提示由病毒感染誘發(fā)的自身免疫反應(yīng)也可能是產(chǎn)生重癥表型的一個可能原因。
這項研究對于理解重癥和輕癥患者的發(fā)病和康復(fù)機制,以及設(shè)計防治SARS-CoV-2感染的疫苗和治療藥物具有重要意義。
黃志偉教授為該研究論文的通訊作者,生命學院副教授張帆、碩士研究生甘銳、博士研究生甄梓期、黑龍江省醫(yī)院感染科主任胡曉麗為該研究論文的并列第一作者,博士研究生李想和周鳳俠對本研究做出了重要貢獻。本研究受到國家自然科學基金委、哈工大青年科學家工作室、哈工大新型冠狀病毒肺炎疫情應(yīng)急科研攻關(guān)項目等基金的資助。
圖一 COVID-19患者針對SARS-CoV-2感染的適應(yīng)性免疫反應(yīng)及免疫記憶建立情況